Vadovaujantis Reglamento reikalavimais, nuo pat pirmųjų biometrinių Lietuvos Respublikos pasų išdavimo dienos, t.y. nuo 2006 m. rugpjūčio 28 d., Asmens dokumentų išrašymo centre įsteigtos Šalies sertifikavimo tarnyba (CSCA tarnyba), kurios paskirtis – sertifikuoti dokumentus pasirašančias institucijas, bei – Asmens dokumentų išrašymo centre išrašomiems dokumentams – dokumento pasirašymo sertifikavimo tarnyba (DS tarnyba), kurios paskirtis – sertifikuoti išrašomą biometrinį dokumentą pasirašančios institucijos parašus.
Į biometrinį dokumentą įrašomas CSCA sertifikatas naudojamas dokumento patikros metu nustatyti asmens dokumentą išdavusią valstybę.
Į biometrinį dokumentą įrašomas DS sertifikatas naudojamas dokumento patikros metu nustatyti biometrinį dokumentą išrašiusią instituciją.
Asmens dokumentų išrašymo centre įsteigtos sertifikavimo infrastruktūros funkcionuoja pagal patvirtintus sertifikavimo veiklos nuostatus. Sertifikatai išduodami ir tvarkomi pagal patvirtintas sertifikatų išdavimo taisykles.
Lietuvos Respublikos biometrinių kelionės dokumentų sprendimai (įskaitant pirštų atspaudus) buvo dalinai patikrinti 2008 m. rugsėjo 7-12 d. Prahoje vykusių biometrinių kelionės dokumentų ir jų patikros sistemų sąveikumo bandymų metu, kur buvo teigiamai įvertinti. Šia patirtimi buvo pasinaudota diegiant biometrinius duomenis į asmens tapatybės korteles.